Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms