Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rprd1bQ9CSU0 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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