Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms