Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hpf1Q8CFE2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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