Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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Ercc8Q8CFD5 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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Ercc8Q8CFD5 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ercc8Q8CFD5 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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Ercc8Q8CFD5 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Ercc8Q8CFD5 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ercc8Q8CFD5 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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