Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms