Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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