Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxa13Q62424 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxa13Q62424 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms