Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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PcolceQ61398 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PcolceQ61398 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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