Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Gm28047Q3US59 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Gm28047Q3US59 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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