Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rpusd2Q149F1 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms