Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
P58686 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
P58686 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms