Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sh3bp1P55194 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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