Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms