Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Hoxd10P28359 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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Hoxd10P28359 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd10P28359 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd10P28359 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Hoxd10P28359 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hoxd10P28359 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Hoxd10P28359 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd10P28359 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms