Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PdgfrbP05622 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms