Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Degs1O09005 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Degs1O09005 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Degs1O09005 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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