Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms