Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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PtprbB2RU80 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PtprbB2RU80 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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