Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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