Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Usp27Q8CEG8 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Usp27Q8CEG8 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms