Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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Atg4aQ8C9S8 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Atg4aQ8C9S8 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Atg4aQ8C9S8 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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