Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CtifQ6PEE2 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms