Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms