Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smarca2Q6DIC0 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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