Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8188-201ENSMUST00000219737 1690 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pilra-201ENSMUST00000058897 2578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Lrtm2-202ENSMUST00000112756 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Xntrpc-201ENSMUST00000084843 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Xntrpc-202ENSMUST00000094129 4150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ckap2l-201ENSMUST00000052708 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3k-201ENSMUST00000039551 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13719-201ENSMUST00000122018 2111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Clstn3-201ENSMUST00000008297 4014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Kcns3-202ENSMUST00000164495 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sat1-202ENSMUST00000112551 896 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21762-201ENSMUST00000177561 456 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Prb3-ps-201ENSMUST00000204675 1111 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Xndc1-202ENSMUST00000106950 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Auts2-217ENSMUST00000187544 3166 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms