Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Cntn3Q07409 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Cntn3Q07409 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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