Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SbdsP70122 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms