Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PtprmP28828 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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