Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pde6aP27664 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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