Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Ggta1P23336 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ggta1P23336 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms