Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtpraP18052 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtpraP18052 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms