Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LtaP09225 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LtaP09225 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LtaP09225 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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