Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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Ccl20O89093 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccl20O89093 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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