Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Gm28048F7BCN0 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms