Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Clip3B9EHT4 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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Clip3B9EHT4 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Clip3B9EHT4 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms