Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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