Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Usp29Q9ES63 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Usp29Q9ES63 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Usp29Q9ES63 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms