Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rnf6Q9DBU5 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rnf6Q9DBU5 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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