Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NubplQ9CWD8 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NubplQ9CWD8 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms