Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Atg3Q9CPX6 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Atg3Q9CPX6 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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