Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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Trim12aQ99PQ1 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Trim12aQ99PQ1 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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