Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PtprtQ99M80 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms