Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Top1mtQ8R4U6 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms