Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms