Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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NischQ80TM9 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NischQ80TM9 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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