Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Sft2d1Q5SSN7 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms