Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 A730065G17Rik-201ENSMUST00000217082 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Lrrc43Q3V0L5 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms