Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Q3U6N9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Q3U6N9 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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