Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gfi1P70338 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms